MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	CGG	2	6	70	75	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018179	A	6	6	90	95	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018179	GT	3	6	99	104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018179	CG	3	6	250	255	0 %	0 %	50 %	50 %	400752654
5	NC_018179	TCGGC	2	10	265	274	0 %	20 %	40 %	40 %	400752654
6	NC_018179	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752654
7	NC_018179	TCG	2	6	355	360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018179	GCT	2	6	378	383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018179	CAGC	2	8	468	475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018179	GCAG	2	8	511	518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018179	GGC	2	6	553	558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018179	TCG	3	9	566	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018179	CCT	2	6	605	610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018179	GAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018179	TGA	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018179	GCT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018179	A	6	6	892	897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018179	AAG	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018179	GTGG	2	8	1064	1071	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018179	GAAG	2	8	1193	1200	50 %	0 %	50 %	0 %	400752655
21	NC_018179	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752655
22	NC_018179	CTT	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752655
23	NC_018179	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752655
24	NC_018179	GGGA	2	8	1357	1364	25 %	0 %	75 %	0 %	400752655
25	NC_018179	GC	3	6	1383	1388	0 %	0 %	50 %	50 %	400752655
26	NC_018179	TCCG	2	8	1476	1483	0 %	25 %	25 %	50 %	400752655
27	NC_018179	GTC	2	6	1521	1526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752655
28	NC_018179	GAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752655
29	NC_018179	GC	3	6	1579	1584	0 %	0 %	50 %	50 %	400752655
30	NC_018179	TTG	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752655
31	NC_018179	CGT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018179	GGCGC	2	10	1925	1934	0 %	0 %	60 %	40 %	400752656
33	NC_018179	TCGC	2	8	1975	1982	0 %	25 %	25 %	50 %	400752656
34	NC_018179	GC	3	6	1981	1986	0 %	0 %	50 %	50 %	400752656
35	NC_018179	CTC	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752656
36	NC_018179	ATCGT	2	10	2020	2029	20 %	40 %	20 %	20 %	400752656
37	NC_018179	GCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752656
38	NC_018179	GTCCG	2	10	2163	2172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018179	GCG	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018179	GAC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018179	GCA	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018179	GAG	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018179	GAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
44	NC_018179	TAG	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
45	NC_018179	CGA	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
46	NC_018179	GCAC	2	8	2608	2615	25 %	0 %	25 %	50 %	400752657
47	NC_018179	GAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752657
48	NC_018179	CCA	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752657
49	NC_018179	ACCG	2	8	2860	2867	25 %	0 %	25 %	50 %	400752657
50	NC_018179	AGC	2	6	2908	2913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752657
51	NC_018179	GCC	2	6	2928	2933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752657
52	NC_018179	GTC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752657
53	NC_018179	ATG	2	6	3039	3044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752657
54	NC_018179	CGAT	2	8	3066	3073	25 %	25 %	25 %	25 %	400752657
55	NC_018179	CAT	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
56	NC_018179	CGC	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752658
57	NC_018179	ATC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752658
58	NC_018179	GAT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752658
59	NC_018179	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752658
60	NC_018179	CGATG	2	10	3433	3442	20 %	20 %	40 %	20 %	400752658
61	NC_018179	CG	3	6	3443	3448	0 %	0 %	50 %	50 %	400752658
62	NC_018179	GAG	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752658
63	NC_018179	GCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
64	NC_018179	CGG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752658
65	NC_018179	GCAT	2	8	3687	3694	25 %	25 %	25 %	25 %	400752658
66	NC_018179	CGA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018179	CGG	2	6	3829	3834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018179	CGA	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018179	GTCA	2	8	3940	3947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018179	GCC	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018179	AGC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
72	NC_018179	CAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752659
73	NC_018179	ATCG	2	8	4168	4175	25 %	25 %	25 %	25 %	400752659
74	NC_018179	ATCC	2	8	4309	4316	25 %	25 %	0 %	50 %	400752659
75	NC_018179	GACT	2	8	4389	4396	25 %	25 %	25 %	25 %	400752659
76	NC_018179	TCCA	2	8	4477	4484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018179	CATCA	2	10	4601	4610	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_018179	CGG	2	6	4656	4661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
79	NC_018179	GGC	2	6	4687	4692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
80	NC_018179	CG	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	400752660
81	NC_018179	CGG	2	6	4769	4774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752660
82	NC_018179	AGCGC	2	10	4923	4932	20 %	0 %	40 %	40 %	400752660
83	NC_018179	CCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752660
84	NC_018179	GGT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
85	NC_018179	GAA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752660
86	NC_018179	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752660
87	NC_018179	CTG	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
88	NC_018179	CGT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
89	NC_018179	CGA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
90	NC_018179	GAG	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752660
91	NC_018179	GACCAA	2	12	5377	5388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	400752660
92	NC_018179	TCG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
93	NC_018179	CAT	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752660
94	NC_018179	TGC	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752660
95	NC_018179	GCAGCC	2	12	5727	5738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	400752660
96	NC_018179	TGG	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752660
97	NC_018179	CACCT	2	10	5750	5759	20 %	20 %	0 %	60 %	400752660
98	NC_018179	CAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
99	NC_018179	GCA	2	6	5797	5802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752660
100	NC_018179	AAC	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018179	GTG	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018179	GGTG	2	8	5914	5921	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018179	AAT	2	6	6007	6012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018179	CGC	2	6	6072	6077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
105	NC_018179	GCC	2	6	6167	6172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752661
106	NC_018179	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752661
107	NC_018179	TCT	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752661
108	NC_018179	CTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
109	NC_018179	GAACTC	2	12	6249	6260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	400752661
110	NC_018179	CGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752661
111	NC_018179	GTC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752661
112	NC_018179	GGCC	2	8	6303	6310	0 %	0 %	50 %	50 %	400752661
113	NC_018179	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752661
114	NC_018179	GC	3	6	6336	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	400752661
115	NC_018179	TGA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752662
116	NC_018179	CGG	3	9	6416	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752662
117	NC_018179	GGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752662
118	NC_018179	CGT	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752662
119	NC_018179	TCT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018179	GAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018179	GGCC	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018179	AGG	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018179	GCTG	2	8	6908	6915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018179	GCC	2	6	6954	6959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018179	GCG	2	6	6990	6995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018179	TGA	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018179	GTT	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018179	G	6	6	7074	7079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018179	CGAGG	2	10	7190	7199	20 %	0 %	60 %	20 %	400752663
130	NC_018179	TGC	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752663
131	NC_018179	CTT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752663
132	NC_018179	ATG	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752663
133	NC_018179	TCC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752663
134	NC_018179	AAT	2	6	7341	7346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752663
135	NC_018179	CCT	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018179	CGT	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018179	ATT	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018179	CAG	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_018179	GGT	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_018179	CGC	2	6	19014	19019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_018179	TAT	2	6	19041	19046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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